محمدجواد ظریف وزیر خارجه کشورمان در صفحه توئیتر خود با زبان عربی در تقدیر از فعالیت های و مجاهدت های بی بدیل آیت الله سیستانی نوشت:

«آیت الله سیستانی ، مرجع عالی قدر (شیعه) دژ مستحکم عراق و ضامن امنیت منطقه و اندوخته‌ای برای تمام جهان اسلام به شمار می‌رود.ایران از نقش ایشان در ایجاد امنیت و ثبات در عراق و حفظ حاکمیت و یکپارچگی این کشور و رهایی از نیروهای اشغالگر و همچنین ساخت عراقی جدید بر اساس خواسته‌های ملت این کشور تقدیر می‌کند.»

سخنگوی وزارت خارجه کشورمان امروز در نشست خبری درباره انتقادات روزنامه کیهان به آیت‌الله سیستانی هم تصریح کرد: این موضع ربطی به ارکان جمهوری اسلامی ایران ندارد. ایران نظامی است که براساس مرجعیت شکل گرفته است که مرجعیت در ایران و عراق حافظ صلح امنیت و ثبات دو کشور بوده است.

خطیب‌زاده با بیان اینکه آیت‌الله سیستانی نقش بی‌بدیلی در عراق و جایگاه رفیعی در شیعیان جهان دارند، خاطرنشان کرد: آنچه را که گفته‌ایم و امروز می‌گویم خواست و مواضع ارکان نظام است که جز احترام به این رکن رکین نکته دیگری نداریم. تحمل هم نخواهیم که کسی به جایگاه مرجعیت تخطی داشته باشد.