در متن پیام جهانگیری آمده است : رحلت عالم ربانی و وارسته آیت الله سید یحیی جعفری نماینده ولی فقیه و امام جمعه سابق کرمان و یار دیرین امام و انقلاب و رهبری ضایعه ای بزرگ برای مردم شریف استان کرمان است.
مصیبت فقدان تاسف بار این روحانی خوشنام که نماد روحانیت روشن بین، مردم دار و معتدل و همواره محور وحدت آحاد مردم و گروه ها و جریان های مختلف سیاسی بود را به عموم مردم قدرشناس استان کرمان، روحانیت استان، علاقه مندان و دوستداران، بستگان به ویژه خانواده ارجمند ایشان صمیمانه تسلیت می گویم و از خداوند متعال برای آن فقید سعید رحمت و رضوان واسعه الهی و علو درجات و برای بازماندگان محترم صبر و اجر مسالت دارم.
این عالم بزرگ در سال ۱۳۵۹ توسط امام خمینی (ره) به عنوان امام جمعه کرمان منصوب شد و در ۲۸ تیر ۱۳۹۶ به علت کهولت سن از این سمت استعفا داد و در ۲۶ آذرماه استعفای وی پذیرفته شد.
آیت الله سید یحیی جعفری عصر امروز (شنبه) در ۸۹ سالگی دعوت حق را لبیک گفت.
