متن پیام حجت الاسلام حسن روحانی به شرح ذیل است:

انالله انا الیه راجعون
رحلت عالم پارسا حضرت آیت الله محسن مجتهد شبستری، ، موجب تاثر و اندوه فراوان شد.
این عالم مجاهد و یار دیرین امام و انقلاب پس از سالها مبارزه در مسیر استقرار نظام مقدس جمهوری اسلامی، در مسئولیت های متعدد سیاسی و اجتماعی همچون عضویت در مجلس خبرگان رهبری و مجمع تشخیص مصلحت نظام، چندین دوره نمایندگی مجلس شورای اسلامی و سال ها خدمت صادقانه در سنگر عبادی و سیاسی نماز جمعه کارنامه ارزشمند و پرافتخاری از خود برجا گذاشت که یقینا در خاطر مردم قدرشناس ایران باقی خواهد ماند.
 اینجانب این ضایعه را به مردم شریف استان آذربایجان شرقی، حوزه های علمیه، اعضای محترم مجلس خبرگان رهبری و مجمع تشخیص مصلحت نظام، شاگردان و دوستداران و به ویژه  بیت شریف آن عالم مجاهد تسلیت می گویم و از درگاه خداوند متعال برای  ایشان علو درجات و همجواری با ائمه اطهار(ع) و برای عموم بازماندگان صبر و سلامتی مسالت دارم.

حسن روحانی