متن پیام حضرت آیت‌الله خامنه‌ای به این شرح است:

«بسم الله الرحمن الرحیم

خاندان محترم و معزز حکیمی

درگذشت جناب حجة‌الاسلام آقای حاج شیخ علی آقا حکیمی -رحمة الله علیه- را به خانواده‌ی مکرم و نیز به اخوان بزرگوار ایشان تسلیت عرض می‌کنم. آن مرحوم همه‌ی عمر را با آزادگی و سلامت نفس و پرهیزکاری گذرانید و امید است که اکنون در پناه رحمت و رضوان الهی قرار گرفته است. ان‌شاء الله

سیدعلی خامنه‌ای

۱۴۰۰/۴/۳۲»